- 病原体基因检测平台
- 致病微生物溯源分析平台
- 未知病原体检测平台
建设内容
以新冠病毒基因库为基础,搭建首个供全国使用的病原体检测分析平台, 实现了全单位系统基因测序与分析技术力量的统筹与整合, 每秒钟可接收1000株病毒的fasta文件,并且每小时可完成40株病毒的分析工作
建设成果
搭建了整合单位总部与全国所有地方分部的大型联动操作系统,同时满足管理与业务需求,实现从科研层面落地到应用报告的转化。
建立独立自主的病毒数据库,与国际主流数据库同步更新,确保生物数据安全,防止数据泄露,为病毒防控工作持续开展打下基础。
完成新冠病毒精准分析报告,为病毒溯源和疫情防控提供重要决策辅助工作,交付初期已在国内10个最大地方分部同步运行。
建设内容
搭建了食源性微生物菌株的毒力检测及溯源系统,对菌株的危害性以及传播关系进行深入分析。 系统通过对食源性微生物菌株二代测序数据进行基因组组装及后续溯源分析,实现菌株MLST与cgMLST位点序列库建库,以及数据加载分析,并提供定制报告。
建设成果
结合院士科研理论开发的业务系统,解决了致病微生物隐秘传播过程难以准确跟踪的问题,可应用与环境监测和食品安全领域。
系统同时落地应用在医院临床有害菌病毒来源检测、工业生产环节有害菌检测以及动物畜牧养殖过程的防疫检测。
建设内容
收录十余种国内外全方位的生物信息学数据库。各数据库数量:细菌 > 100,000种; 病毒 > 30,000种; 真菌 > 2,000种; 寄生虫 > 2,000种,完成病原体生物遗传数据库的初始建库工作,通过将序列与已有数据库进行比对,实现未知病原体到“种水平”的识别。
建设成果
依托现有软件平台,在极低建设和学习成本的情况下,扩大了单位病原体的监测范围,增强了团队的生信分析能力。
整合单位不同研究团队的数据、流程等资源,作为共同协作平台提高了单位应对突发未知疫情的防控能力。